第一部分:研究设计阶段
1.1 文献调研:明确研究方向
明确目的
- 确定研究的目标疾病或人群
- 了解该领域的研究现状、争议点与空白
检索手段
- 常用数据库:PubMed、Web of Science、Embase、Google Scholar
- 文献获取:通过DOI在Sci-Hub、ResearchGate或图书馆数据库中获取全文
- 检索词构建技巧:
- 使用 AND 连接不同概念,缩小范围
- 使用 OR 连接同义词,扩大范围
- 示例:("ASD" OR "autism") AND ("resting state" OR "rs-fMRI") AND ("functional connectivity" OR "FC")
整理文献的关键信息
- 实验目的、被试类型与数量、纳排标准、量表采集、扫描参数、分析方法、主要结果、局限性
💡 小贴士:建议使用文献管理工具(如Zotero、EndNote)统一管理文献,并建立Excel文献梳理表,便于后续快速检索与对比。
1.2 文献梳理表
建立一个Excel表格,包含以下列:
|标题|年份|期刊|影响因子|样本量|模态|分析方法|主要结果|局限性
💡 小贴士:梳理10-20篇高质量文献后,可以回答以下问题:
- 样本量通常是多少?(帮助确定自己的样本量目标)
- 常用的纳排标准有哪些?(帮助设计入组条件)
- 哪些量表被频繁使用?(必须采集,便于后续比较)
- 哪些分析方法已经做过?(避开重复,寻找创新点)
第二部分:实验设计方案制定
2.1 样本量确定
- 方法一:参考文献梳理表中的样本量范围,取中位数或略高于常见值
- 方法二:使用G*Power等软件进行功效分析(effect size可参考既往研究或取中效应量)
- 注意:样本量过小易导致假阴性,过大则增加采集成本与质控压力
2.2 纳排标准制定
- 通用标准:参照该领域的高质量文献,保持一致性
- 常见排除因素:
- 颅内有金属植入物、起搏器等MRI禁忌
- 严重头部外伤史、神经系统疾病史(与研究疾病无关)
- 严重精神疾病(如精神分裂症,除非作为研究对象)
- 磁共振扫描禁忌症(幽闭恐惧症等)
2.3 量表采集
- 原则:参照文献中高频使用的量表,优先采集
- 采集时机:可在扫描前或扫描后完成,建议扫描前完成,避免扫描后被试疲惫
- 格式:问卷星、纸质版均可,建议电子化便于后期整理
- 常见量表类型:
- 认知功能:MMSE、MoCA
- 情绪状态:HAMD、HAMA
- 日常功能:ADL
- 疾病特异性量表:如自闭症谱系采用ADOS、SCQ等
⚠️ 注意:量表采集应尽量一次性完成,后期补充难度大、成本高。
2.4 扫描序列与参数设计
- 序列类型:
- 定位像(localizer):用于定位
- 功能像(rs-fMRI):核心序列
- 结构像(T1-weighted):用于配准与分割
- 弥散像(DTI/DWI):可选,用于结构连接分析
- 场图(field map):可选,用于EPI畸变校正
- 参数参考:
- 功能像:TR ≤ 2000 ms,层数 ≥ 30,体素 ≤ 3.5 mm各向同性,时长 ≥ 6 min(180个时间点)
- 结构像:体素 ≤ 1 mm³,矢状面采集,完整覆盖全脑
💡 小贴士:参数设计应结合本中心设备性能,参考文献参数,并预留1-2个被试进行测试扫描,确认图像质量后再大规模采集。
2.5 分析方法规划
- 常用分析:ALFF/fALFF、ReHo、FC、网络分析、SVM分类等
- 创新点来源:
- 方法创新:引入新指标(如INT、GSCORR)
- 样本创新:关注特殊亚组(如不同病程、不同治疗反应)
- 设计创新:纵向随访、干预前后对比
第三部分:实验前准备
3.1 伦理审查与资格认定
- 伦理审查流程:
- 提交伦理申请材料(研究方案、知情同意书、问卷等)
- 等待伦理委员会审批(通常需2-4周)
- 获得伦理批件后方可开展实验
- 磁共振主试资格:
- 参加磁共振室组织的安全培训
- 通过安全知识考试
- 获得操作权限(如门禁、系统账号)
3.2 实验程序调试
- 与扫描技师沟通:
- 提前1-2天到实验室,确认设备可用时间
- 沟通扫描序列与参数,确认设备支持
- 记录最终使用的参数,便于后续论文撰写
- 预实验(pilot):
- 招募1-2名健康志愿者(可为课题组成员)
- 完整模拟实验流程(从签署知情同意书到扫描完成)
- 收集反馈:指导语清晰度、按键舒适度、镜片清晰度、噪音感受等
- 根据反馈优化实验细节
3.3 文档准备
需提前准备并打印以下文件:
- 知情同意书:含课题名称、研究目的、实验流程、风险说明、被试权利、签字栏
- 保密协议:防止前后被试交流影响结果
- 被试基本情况调查表:姓名、性别、年龄、利手、教育年限、联系方式等
- 核磁安全筛查表:金属植入物、手术史、幽闭恐惧症等
- 被试费领取表:姓名、身份证号、金额、签字、日期(符合单位报销要求)
💡 小贴士:所有文件可提前制作成二维码,方便被试扫码填写电子版,同时保留纸质版备查。
3.4 被试招募与预约
- 招募渠道:
- 医院门诊/住院部(患者)
- 社区、学校、线上平台(健康对照)
- 课题组内部、志愿者群
- 招募信息要素:
- 实验目的、时长、流程
- 被试要求(年龄、性别、健康状况)
- 实验地点、时间
- 报酬金额与支付方式
- 预约安排:
- 建立Excel预约表,记录:编号、姓名、联系方式、预约时间、实际到达时间、扫描状态
- 建议被试提前20分钟到达,留出签署文件、更换衣物、练习任务的时间
第四部分:数据采集现场
4.1 接待被试
- 引导与签到:被试到达后,引导至休息区,核对预约信息
- 文件签署:
- 讲解知情同意书内容,回答疑问,确认签字
- 填写安全筛查表,仔细核对有无金属植入物
- 实验讲解:
- 说明整个流程与时长
- 指导被试阅读指导语,进行任务练习(如有)
- 确认被试理解实验要求
- 安全检查:
- 再次询问金属物品(手机、钥匙、银行卡、发夹等)
- 更换无金属衣物(如需)
- 检查眼镜度数,配置专用镜片
4.2 进入磁共振室
- 佩戴耳塞:协助被试佩戴,确保舒适
- 提供按键设备:告知按键功能,让被试试按确认
- 体位调整:
- 协助被试仰卧,头部置于线圈中心
- 使用海绵垫固定头部,询问是否有不适点
- 引导被试观看镜子,确认能清晰看到显示屏
- 最后提醒:
- “保持身体不动,尽量保持清醒,不要睡着”
- “有任何不适可以随时通过话筒告诉我们”
- 离开前再次确认无金属物品
4.3 数据采集注意事项
参数一致性:同一批次被试的扫描参数必须完全一致,不可中途修改
患者与对照同步采集:避免先集中采集患者再集中采集对照,便于及时调整两组的人口学匹配
静息态状态统一:同一批被试保持相同的静息状态(睁眼/闭眼),睁眼时可注视固定点,闭眼时不要睡着
实时质控:扫描开始后,在操作间观察图像实时质量,如发现严重头动或信号异常,可及时重扫
数据备份:扫描完成后当天完成数据导出与备份,避免遗漏或混乱
第五部分:扫描后工作
5.1 被试离场
- 引导被试离开磁体间,取回个人物品
- 引导至休息区,询问有无不适
- 完成剩余量表填写(如有)
- 填写被试费领取表,发放报酬
- 确认被试状态良好后离开
5.2 数据整理与备份
当天完成以下工作:
- 数据导出:从扫描仪导出DICOM数据,按被试编号命名文件夹
- 格式转换:使用dcm2niix等工具将DICOM转换为NIFTI格式,确认转换成功
- 影像整理表:记录每个被试的扫描序列、时间点数量、参数、质量初步判断
- 人口信息整理:将量表、基本情况录入Excel,与被试编号一一对应
- 备份:至少备份至两个不同存储介质(如移动硬盘+云盘/服务器)
第六部分:数据质量检查
及时对数据质量进行检查,对于不合格数据可考虑及时补充采集。不同序列的检查要点如下:
6.1 功能像序列
单层图像:检查有无信号丢失、几何变形、鬼影伪影
时间序列:动态播放,观察有无突发尖峰或持续漂移
扫描范围:确认全脑覆盖(头顶至小脑下部)
参数一致性:同一批数据TR、层数、时间点数量一致
头动参数:平均帧间位移(FD)> 0.5 mm或 > 3° 建议剔除或进一步处理
配准效果:检查EPI与T1或模板的对齐情况
6.2 结构像序列
整体图像
无运动伪影、带状伪影、异物干扰
灰白质对比
灰白质边界清晰,便于后续分割
扫描范围
完整覆盖全脑,无缺失
IQR评分
可参考IQR质量评分,剔除质量较差的图像
6.3 弥散像序列
参数一致性:B值、方向数、层数一致
b0图像:无明显变形、信号丢失、鬼影
彩色FA图:纤维束走向连续、符合解剖结构
头动与涡流:各方向图像无明显位移或变形
6.4 人口信息检查
编号唯一性:每个被试有唯一编号,与影像数据对应
基础信息完整:组别、年龄、性别、教育年限、利手等齐全
量表数据完整:与研究相关的量表无缺失
💡 建议格式:
SubjID|group|age|sex|education|handness|MMSE|HAMD|...